在优化整合后的重点研发计划中，将专门设立基础研究类重点专项，基本思路是：对于方向性的重大科学前沿，要突出科学目标，进行前瞻性布局，抢占科学制高点；对于事关国家发展战略的基础研究，应更加体现国家意志，着眼未来国家竞争力，进行战略性部署。具体将分为四类：重大科学研究类专项、依托大科学装置研究类专项、重大科学前沿与学科交叉类专项、面向未来经济社会发展的重点基础研究类专项。基础研究类重点专项将在国家重点研发计划中保持合理比重，稳定一批长期服务于国家目标的基础研究队伍。对产业目标明确、可进行全创新链设计的重点专项，也应围绕总体目标，切实加强基础研究，为自主创新提供源头。对专项项目群中的基础研究项目，其申报要求、立项评议标准和考核验收等方面要适合基础研究的特点，区别于技术开发和应用类项目；国家将在重点研发计划管理办法、实施细则中建立相应的管理机制，实行分类指导、评价和管理。此外，科技部将进一步加强国家实验室、国家重点实验室等科研基地的建设布局，支持科研条件平台建设，促进科技资源开放共享，支持创新人才和优秀团队的科研工作，着力提升创新能力。

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