根据中央要求，为确保学习实践活动的顺利开展、取得实效，科技部组成深入学习实践科学发展观活动领导小组。组长由部党组书记李学勇担任。领导小组下设办公室，具体负责科技部开展深入学习实践活动的实施方案草拟、文件起草、活动安排，及对部属各单位指导检查、宣传和条件保障等工作。
    办公室下设四个工作组，分别为组织协调组、文件组、指导检查组、宣传保障组。组织协调组主要负责实施方案、召开会议、组织学习和调研、沟通联络、征求意见等工作；文件组主要负责科技部实践活动的报告、领导讲话、学习情况通报、汇报材料、学习材料汇编、征求意见、典型经验总结等文件起草工作；指导检查组主要负责对部属机关和事业单位学习实践活动的指导、检查等工作；宣传保障组主要负责新闻宣传、条件保障、工作简报、大事记等工作。